| 順位 | 組-順 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 3-1 | 梅山 優志(2) 大分 | 大分舞鶴高 | 4'04"27 | |
| 2 | 3-2 | 安部蔵乃介(3) 大分 | ｻｻﾞﾝｶRC | 4'07"37 | |
| 3 | 3-3 | 篠崎 未來(3) 大分 | 大分舞鶴高 | 4'08"90 | |
| 4 | 3-4 | 北川 博規 大分 | 別府自衛隊 | 4'09"19 | |
| 5 | 3-5 | 鳥越 惺凪(3) 大分 | 大分東明高 | 4'15"76 | |
| 6 | 3-6 | 畔津大治郎(2) 大分 | 臼杵高 | 4'16"57 | |
| 7 | 2-1 | 小野 景(3) 大分 | 大分西高 | 4'18"38 | |
| 8 | 2-2 | 栗林 大樹 大分 | 大分陸協 | 4'19"74 | |
| 9 | 2-3 | 有田 翔瑛 大分 | LEGACY | 4'20"76 | |
| 10 | 2-4 | 藤元 裕也 大分 | 別府自衛隊 | 4'21"46 | |
| 11 | 2-5 | 猪原 澄空(3) 大分 | ｻｻﾞﾝｶRC | 4'25"90 | |
| 12 | 2-6 | 後藤 幸治 大分 | 日田市陸協 | 4'26"63 | |
| 13 | 2-7 | 利光 凛人(1) 大分 | 稙田中 | 4'26"88 | |
| 14 | 3-7 | 岩本 旺晟(3) 大分 | 大分舞鶴高 | 4'27"08 | |
| 15 | 2-8 | 阿曽生真広(2) 大分 | ｻｻﾞﾝｶRC | 4'27"60 | |
| 16 | 2-9 | 古澤 直樹 大分 | 大分県庁 | 4'29"52 | |
| 17 | 3-8 | 河野 宅摩(2) 大分 | 高田高 | 4'31"15 | |
| 18 | 2-10 | 福永 怜平(2) 大分 | 中津南高 | 4'31"42 | |
| 19 | 1-1 | 白根 拓馬(2) 大分 | 大分舞鶴高 | 4'32"75 | |
| 20 | 1-2 | 志賀 勇輝 大分 | LEGACY | 4'37"44 | |
| 21 | 1-3 | 長尾 貴幸 大分 | 大分陸協 | 4'37"96 | |
| 22 | 1-4 | 三浦 武大(2) 大分 | 輝AC | 4'38"23 | |
| 23 | 1-5 | 正岡 良彦 大分 | 大分ﾏｽﾀｰｽﾞ | 4'38"84 | |
| 24 | 1-6 | 大塚 智也(1) 大分 | 高田高 | 4'43"10 | |
| 25 | 1-7 | 溝邉 晋作(2) 大分 | 挾間中 | 4'43"93 | |
| 26 | 1-8 | 大塚 尚輝(4) 大分 | 大分大 | 4'47"48 | |
| 27 | 1-9 | 後藤 優人(3) 大分 | 大分舞鶴高 | 4'48"37 | |
| 28 | 1-10 | 細田 将晴(2) 大分 | 大分大 | 4'49"83 | |
| 3- | 吉田 優大 大分 | DIGNITY | 欠場 | ||
| 3- | 太田 瑠星 大分 | 大分陸協 | 欠場 | ||
| 1- | 安藤 慎悟 大分 | 大分陸協 | 欠場 |