| 順位 | 組-順 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5-1 | 安東 雅晴(2) 大分 | 佐伯鶴城高 | 52"04 | |
| 2 | 4-1 | 塩月 来夢(2) 大分 | 佐伯鶴城高 | 52"13 | |
| 3 | 5-2 | 藤巻琥大朗(2) 大分 | 大分舞鶴高 | 52"18 | |
| 4 | 3-1 | 山上 諒真(1) 大分 | 大分商業高 | 52"96 | |
| 5 | 5-3 | 深田 羽瑠(2) 大分 | 大分東明高 | 52"97 | |
| 6 | 3-2 | 宮崎 瑠偉(3) 大分 | 三重総合高 | 53"66 | |
| 7 | 5-4 | 岩本 旺晟(2) 大分 | 大分舞鶴高 | 53"70 | |
| 8 | 5-5 | 宿利 守(3) 大分 | 楊志館高 | 53"76 | |
| 9 | 5-6 | 横山虎太郎(3) 大分 | 大分雄城台高 | 54"09 | |
| 10 | 4-2 | 大畠 暖徹(3) 大分 | 楊志館高 | 54"53 | |
| 11 | 4-3 | 渡辺 響(2) 大分 | 大分雄城台高 | 54"91 | |
| 12 | 4-4 | 松下 昂雅(2) 大分 | 楊志館高 | 55"05 | |
| 13 | 2-1 | 岩本 太陽(1) 大分 | 姫島中 | 55"38 | |
| 14 | 4-5 | 徳光 流唯(2) 大分 | 大分東明高 | 55"47 | |
| 15 | 3-3 | 佐藤 蒼(2) 大分 | 大分雄城台高 | 56"66 | |
| 16 | 3-4 | 吉良 拓哉(3) 大分 | 大分商業高 | 57"31 | |
| 17 | 2-2 | 佐藤 佑真(3) 大分 | 挾間中 | 57"94 | |
| 18 | 2-3 | 井餘田陽斗(2) 大分 | 臼杵東中 | 58"48 | |
| 19 | 1-1 | 安部 一洸(3) 大分 | 鶴崎工高 | 58"93 | |
| 20 | 1-2 | 平岡晃太朗(3) 宮崎 | 延岡東海中 | 59"08 | |
| 21 | 2-4 | 伊藤 悠翔(2) 大分 | 稙田西中 | 59"17 | |
| 22 | 1-3 | 森 奏登(2) 大分 | TRISE | 1'00"59 | |
| 23 | 1-4 | 二村 琉生(3) 大分 | 臼杵東中 | 1'00"73 | |
| 24 | 3-5 | 徳永 成吾(2) 大分 | 大分西中 | 1'01"69 | |
| 25 | 2-5 | 池田 明輝(2) 大分 | 鶴崎工高 | 1'01"89 | |
| 26 | 3-6 | 二宮 八大(3) 大分 | 賀来中 | 1'02"23 | |
| 27 | 2-6 | 松原 悠磨 大分 | TRISE | 1'02"58 | |
| 28 | 1-5 | 岡村 優(1) 大分 | 稙田中 | 1'06"57 | |
| 29 | 1-6 | 岩見 りお(2) 大分 | 大在中 | 1'07"45 | |
| 30 | 1-7 | 下川 颯大(2) 大分 | 大在中 | 1'07"57 | .562 |
| 31 | 1-8 | 行時 瑠星(2) 大分 | 大在中 | 1'07"57 | .565 |
| 3- | 黒川 昊瑛(3) 大分 | 大在中 | 欠場 | ||
| 4- | 井上 健(3) 大分 | 楊志館高 | 欠場 | ||
| 5- | 木村 楓(3) 大分 | 楊志館高 | 欠場 | ||
| 4- | 矢野 巧輝(2) 大分 | 大分雄城台高 | 欠場 | ||
| 2- | 吉良 蒼惟(3) 大分 | 臼杵東中 | 欠場 | ||
| 2- | 加藤 高滉(3) 大分 | 上野ヶ丘中 | 欠場 |