| 順位 | 組-順 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2-1 | 東條 吏起(4) 山口 | 日本文理 | 2'06"21 | |
| 2 | 1-1 | 吉田 竜三(3) 福岡 | 北九州高専 | 2'08"46 | |
| 3 | 2-2 | 小水 知朗(2) 長崎 | 日本文理 | 2'08"81 | |
| 4 | 1-2 | 丸田 悠真(2) 福岡 | 北九州高専 | 2'09"33 | |
| 5 | 1-3 | 小畑 聖(4) 大分 | 日本文理 | 2'18"20 | |
| 6 | 1-4 | 吉岡 剛志(2) 岡山 | 日本文理 | 2'19"19 | |
| 7 | 2-3 | 木佐木虹空(3) 大分 | 日本文理 | 2'20"30 | |
| 8 | 1-5 | 南 竣也(3) 大分 | 大分大医学部 | 2'24"29 | |
| 9 | 1-6 | 浅野 束颯(4) 大分 | 大分高専 | 2'29"31 | |
| 2- | 髙木 慶介(4) 大分 | 日本文理 | 欠場 | ||
| 2- | 入口 汰地(2) 熊本 | 日本文理 | 欠場 |