| 順位 | 組-順 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 4-1 | 入口 汰地(1) 熊本 | 日本文理大 | 4'07"61 | |
| 2 | 4-2 | 河本 篤哉(1) 岡山 | 日本文理大 | 4'11"38 | |
| 3 | 4-3 | 野々上由翔(2) 大分 | 日本文理大 | 4'12"22 | |
| 4 | 4-4 | 川野 夏矢(3) 大分 | 大分上野丘高 | 4'13"37 | |
| 5 | 4-5 | 後藤 吏輝(3) 大分 | 大分舞鶴高 | 4'14"86 | |
| 6 | 4-6 | 椎原 海(3) 大分 | 大分雄城台高 | 4'15"47 | |
| 7 | 4-7 | 利光 優真(2) 大分 | 大分雄城台高 | 4'15"69 | |
| 8 | 4-8 | 平野 勇太 大分 | 別府市役所 | 4'19"76 | |
| 9 | 4-9 | 浅野 束颯(4) 大分 | 大分高専 | 4'21"45 | |
| 10 | 3-1 | 麻生 凌雅(3) 大分 | 大分豊府高 | 4'23"16 | |
| 11 | 4-10 | 首藤 淳志(3) 大分 | 大分雄城台高 | 4'23"90 | |
| 12 | 4-11 | 兒玉 颯斗(3) 大分 | 佐伯鶴城高 | 4'25"67 | |
| 13 | 3-2 | 安倍 颯志(3) 大分 | 大分上野丘高 | 4'26"92 | |
| 14 | 4-12 | 徳永 昇生(2) 大分 | 大分西中 | 4'28"87 | |
| 15 | 3-3 | 木下 遥斗(2) 大分 | 大東中 | 4'29"81 | |
| 16 | 3-4 | 鎧坂八一郎(2) 大分 | 城北中 | 4'31"30 | |
| 17 | 2-1 | 市川 大貴(3) 大分 | 別府西中 | 4'31"38 | |
| 18 | 3-5 | 門脇 悠斗(3) 大分 | 大分高専 | 4'31"94 | |
| 19 | 3-6 | 美登 敬仁(2) 大分 | 大東中 | 4'31"95 | |
| 20 | 4-13 | 徳永 拓真 大分 | 大分陸協 | 4'32"51 | |
| 21 | 3-7 | 工藤 陸(3) 大分 | 大分舞鶴高 | 4'33"47 | |
| 22 | 3-8 | 畔津大治郎(3) 大分 | 大在中 | 4'34"96 | |
| 23 | 3-9 | 関 隆晴 大分 | 大分県庁 | 4'35"20 | |
| 24 | 3-10 | 清田 航羽(1) 大分 | 大東中 | 4'35"27 | |
| 25 | 4-14 | 関上 秀吾(3) 大分 | 大分雄城台高 | 4'35"33 | |
| 26 | 3-11 | 稲垣 成道(2) 大分 | 臼杵高 | 4'36"62 | |
| 27 | 3-12 | 平野 翔真(2) 大分 | 大神中 | 4'37"18 | |
| 28 | 3-13 | 梅山 優志(2) 大分 | 城東中 | 4'37"30 | |
| 29 | 2-2 | 佐藤 陽太(2) 大分 | 大分上野丘高 | 4'42"45 | |
| 30 | 2-3 | 髙野 悦成(3) 大分 | 大分上野丘高 | 4'45"33 | |
| 31 | 1-1 | 春那 匠海(2) 大分 | 大在中 | 4'47"69 | |
| 32 | 2-4 | 山﨑 颯介(2) 大分 | 臼杵高 | 4'48"42 | |
| 33 | 1-2 | 須賀 大晟(2) 大分 | 城東中 | 4'48"71 | |
| 34 | 2-5 | 桑原 大河(2) 大分 | 別府西中 | 4'49"11 | |
| 35 | 2-6 | 足立 涼介(3) 大分 | 南大分中 | 4'50"09 | |
| 36 | 1-3 | 松下 昂雅(3) 大分 | 大在中 | 4'52"16 | |
| 37 | 2-7 | 松下 礼恩(2) 大分 | 臼杵東中 | 4'52"79 | |
| 38 | 1-4 | 猪原 颯空(2) 大分 | 城東中 | 4'52"87 | |
| 39 | 2-8 | 麻生 悠悟(3) 大分 | 賀来中 | 4'56"27 | |
| 40 | 2-9 | 弓場 蒼海(3) 大分 | 坂ﾉ市中 | 5'00"48 | |
| 41 | 2-10 | 菊池 大和(3) 大分 | 大分大医学部 | 5'03"79 | |
| 42 | 1-5 | 多嶋田 佑(3) 大分 | 賀来中 | 5'05"57 | |
| 43 | 2-11 | 塚本諒太朗(1) 大分 | 杵築高 | 5'05"99 | |
| 44 | 1-6 | 佐藤 朝陽(2) 大分 | 臼杵東中 | 5'09"31 | |
| 45 | 1-7 | 友利 蓮(2) 大分 | 別府西中 | 5'09"44 | |
| 46 | 1-8 | 小林 瑞輝(2) 大分 | 大在中 | 5'11"72 | |
| 47 | 2-12 | 二村 篤樹(3) 大分 | 臼杵東中 | 5'11"94 | |
| 48 | 1-9 | 弓場 颯馬(2) 大分 | 坂ﾉ市中 | 5'15"41 | |
| 49 | 1-10 | 西村 駿佑(2) 大分 | 臼杵西中 | 5'17"24 | |
| 50 | 1-11 | 江藤 太陽(1) 大分 | 津久見第二中 | 5'18"46 | |
| 51 | 1-12 | 土谷 竜馬(2) 大分 | 臼杵東中 | 5'19"37 | |
| 52 | 1-13 | 三代 晃汰(2) 大分 | 賀来中 | 5'20"53 | |
| 53 | 1-14 | 藤澤 楠(2) 大分 | 坂ﾉ市中 | 5'44"30 | |
| 54 | 1-15 | 川邊虎次郎(2) 大分 | 臼杵東中 | 6'10"03 | |
| 3- | 穴井 優希(2) 大分 | 大在中 | 欠場 | ||
| 1- | 赤嶺 塁(3) 大分 | 野津中 | 欠場 | ||
| 3- | 井野上流星(3) 大分 | 別府西中 | 欠場 | ||
| 2- | 松野 快(1) 大分 | 大東中 | 欠場 | ||
| 4- | 後藤 航大 大分 | 大分陸協 | 欠場 | ||
| 2- | 首藤 成央(3) 大分 | 稙田中 | 欠場 | ||
| 2- | 谷本 龍信(3) 大分 | 坂ﾉ市中 | 欠場 |