| 順位 | 組-順 | 氏名 | 所属 | 記録 | 事由 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 6-1 | 岩男 優(3) 大分 | 大分東明高 | 2'01"08 | |
| 2 | 6-2 | 安心院大渡(3) 大分 | 大分舞鶴高 | 2'01"11 | |
| 3 | 6-3 | 小水 知朗(1) 長崎 | 日本文理大 | 2'02"91 | |
| 4 | 5-1 | 田邉 唯織(2) 大分 | 杵築高 | 2'03"88 | |
| 5 | 6-4 | 兒玉 颯斗(3) 大分 | 佐伯鶴城高 | 2'04"47 | |
| 6 | 6-5 | 南 隼人(1) 大分 | 杵築高 | 2'05"93 | |
| 7 | 4-1 | 大戸 基暉(3) 大分 | 大分高 | 2'06"48 | |
| 8 | 5-2 | 平野 勇太 大分 | 別府市役所 | 2'07"00 | |
| 9 | 4-2 | 安達 縁(2) 大分 | 佐伯豊南高 | 2'07"01 | |
| 10 | 4-3 | 内田 佳壱(2) 大分 | 杵築高 | 2'07"43 | |
| 11 | 5-3 | 工藤 皓晟(2) 大分 | 佐伯鶴城高 | 2'07"75 | |
| 12 | 5-4 | 辰本 可成(3) 大分 | 臼杵東中 | 2'08"01 | |
| 13 | 4-4 | 山上 泰雅(2) 大分 | 大分豊府高 | 2'08"84 | |
| 14 | 5-5 | 木下 遥斗(2) 大分 | 大東中 | 2'08"85 | |
| 15 | 5-6 | 松田 智寛(2) 大分 | 大分中央陸上 | 2'09"24 | |
| 16 | 4-5 | 藤野 蒼天(2) 大分 | 楊志館高 | 2'10"11 | |
| 17 | 3-1 | 鎧坂八一郎(2) 大分 | 城北中 | 2'10"35 | |
| 18 | 3-2 | 畔津大治郎(3) 大分 | 大在中 | 2'14"68 | |
| 19 | 6-6 | 後藤 煌心(3) 大分 | 杵築高 | 2'14"93 | |
| 20 | 3-3 | 平野 翔真(2) 大分 | 大神中 | 2'15"19 | |
| 21 | 2-1 | 梅山 優志(2) 大分 | 城東中 | 2'15"65 | |
| 22 | 3-4 | 松下 礼恩(2) 大分 | 臼杵東中 | 2'15"85 | |
| 23 | 3-5 | 多田 敬大(3) 大分 | MeLine Athlete | 2'16"38 | |
| 24 | 4-6 | 二村 篤樹(3) 大分 | 臼杵東中 | 2'17"04 | |
| 25 | 1-1 | 割石 蓮翔(2) 大分 | 城北中 | 2'17"49 | |
| 26 | 4-7 | 坂本 一樹(3) 大分 | 楊志館高 | 2'17"67 | |
| 27 | 3-6 | 春那 匠海(2) 大分 | 大在中 | 2'18"03 | |
| 28 | 3-7 | 泉 征吾(3) 大分 | 佐伯豊南高 | 2'18"50 | |
| 29 | 2-2 | 鳥越 惺凪(2) 大分 | 大東中 | 2'20"02 | |
| 30 | 2-3 | 松下 昂雅(3) 大分 | 大在中 | 2'20"22 | |
| 31 | 1-2 | 三ﾉ宮 勝利(2) 大分 | 臼杵高 | 2'20"54 | |
| 32 | 1-3 | 須賀 大晟(2) 大分 | 城東中 | 2'20"62 | |
| 33 | 2-4 | 井嶋 智也(2) 大分 | 臼杵高 | 2'21"11 | |
| 34 | 1-4 | 猪原 颯空(2) 大分 | 城東中 | 2'21"63 | |
| 35 | 2-5 | 弓場 蒼海(3) 大分 | 坂ﾉ市中 | 2'22"52 | |
| 36 | 2-6 | 谷本 龍信(3) 大分 | 坂ﾉ市中 | 2'23"82 | |
| 37 | 2-7 | 後藤 優人(3) 大分 | 大在中 | 2'25"69 | |
| 38 | 1-5 | 弓場 颯馬(2) 大分 | 坂ﾉ市中 | 2'29"14 | |
| 39 | 1-6 | 西村 駿佑(2) 大分 | 臼杵西中 | 2'31"65 | |
| 40 | 1-7 | 石橋 樹(1) 大分 | 大分中央陸上 | 2'37"05 | |
| 41 | 1-8 | 川野 琥(2) 大分 | 津久見第二中 | 2'37"15 | |
| 2- | 佐藤 朝陽(2) 大分 | 臼杵東中 | 2'28"96 | 失格 | |
| 6- | 越海 翔太(3) 大分 | 杵築高 | 欠場 | ||
| 5- | 徳永 昇生(2) 大分 | 大分西中 | 欠場 |